De meeste aquariumvissen komen uit tropische wateren en hebben watertemperaturen tussen 22 en 30°C nodig. In gezelschapsaquariums met vissen/ ongewervelden uit verschillende regionen is een watertemperatuur van 24-26 °C correct gebleken. Alleen voor het kweken van, bijvoorbeeld, discus is 30 °C zinvol. Veel garnalensoorten komen uit koelere wateren en verdragen temperaturen van 25-30 °C niet.
De watertemperatuur kan het beste worden ingesteld met een "regelbare verwarming" die de temperatuur automatisch regelt. Hiervoor zijn er staafvormige verwarmingen in verschillende Watt-sterktes die in het aquarium worden bevestigd (JBL ProTemp s) en externe verwarmingen/ doorstroomverwarmingen, in twee Watt-sterktes, die ingebouwd worden in de slang waardoor het terugkerende water stroomt (JBL ProTemp e). Het voordeel van de externe verwarming is dat het een product is dat niet IN het aquarium moet worden geplaatst en de verdeling van de warmte in het aquarium is gelijkmatiger. Daarnaast laat het digitale display van de externe verwarming de actuele watertemperatuur altijd duidelijk leesbaar zien. De externe verwarming kan uiteraard dook met een afzonderlijke waterpomp worden ingezet.
Een bodemverwarming dient NIET voor het regelen van de watertemperatuur. Een bodemverwarmingskabel zorgt in het aquarium voor een betere doorstroming van de bodemgrond daar het verwarmde water bij de kabel opstijgt en voor een stroming in de ruimtes tussen de kabel zorgt. Zo worden voedingsstoffen tot aan de plantenwortels gespoeld en zorgen voor een perfecte plantengroei. Bodemverwarmingskabels moeten altijd aangevuld worden met een "primaire verwarming" (JBL ProTemp s of e).
